Francisco Morázan tiene cinco meses de estar en Costa Rica donde ha sido nombrado Jefe Provisional del Estado. Ha convocado a elecciones para instalar una Asamblea Nacional Constituyente, la que debe dar una estructura legal al estado costarricense. La Asamblea ha decretado la vigencia de la constitución de 1825, la misma que tuvo la Federación Centroamericana; ha declarado la adhesión de Costa Rica a la Republica de Centroamerica; ha autorizado a través de decreto especial a Francisco Morazán para que organice las fuerzas necesarias para volver a integrar la República y lo ha declarado Libertador de Costa Rica. Dos meses después Francisco Morazán es fusilado una tarde del 15 de Septiembre de 1842.
Una rebelión de soldados de San José y de Alajuela, en Costa Rica, contra el gobierno de Francisco Morazán ha generado el acoso al cuartel donde éste está refugiado con un grupo de soldados leales, desde el 11 de septiembre hasta el 14 del mismo mes, día en el cual Morazán decide romper el cerco que le han tendido más de tres mil soldados rebeldes. Después de romper el cerco, Morazán se dirige a Cartago donde espera que sus amigos lo apoyen con tropas frescas para hacer frente a la rebelión. Al llegar a Cartago descubre que sus amigos lo han traicionado, y sin darle tiempo a ninguna acción de defensa, es alcanzado por las tropas que lo han venido persiguiendo desde San José, y es puesto preso junto a sus acompañantes. La decisión de los enemigos de Morazán es que este debe ser regresado a San José para ser fusilado inmediatamente.
